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  国家优秀青年基金获得者
 
姜 雨

一、基本信息

姜雨,1983年生,男,教授,农业基因组大数据课题组负责人,博士生导师。

二、工作学习经历

2002-2006  复旦大学 生命科学院 理学学士

2006-2011    中国科学院 昆明动物所 遗传学博士

2011-2013  澳大利亚联邦科学院 家畜产业所 博士后

2013-2015  西北农林科技大学 动物科技学院 副教授

2015-至今     西北农林科技大学 动物科技学院 教授

三、研究方向

利用分子进化和群体遗传学理论,分析农业领域在组学时代产生的海量数据,找到在长期进化和人工选育过程中,决定关键农业性状的主效基因/具体突变,并通过实验解析其分子机制。特别关注反刍类家畜,其作为陆地上最主要的草食动物,研究其能高效利用不同生态地域饲草进行前胃发酵的遗传成因,这对理解瘤胃菌群生态系统进化,通过仿生学研制人工瘤胃具有重要意义。在辅助育种应用领域,参与了目前国际上广泛使用的 600K 绵羊芯片的研制,并作为协调人以联盟形式设计和定制了适用于研究中国绵羊群体的高密度 SNP 芯片,将中国绵羊可用的有效位点比例大幅提高,同时降低了SNP 芯片的使用成本。

通过长期研究各种牛羊基因组变异与性状关联关系,我们解析出构成瘤胃壁的特异基因家族和反刍动物特有的脂类合成代谢途径,部分解释了瘤胃和羊毛脂产生的遗传基础,发表在 Science杂志。通过创新生物信息学分析方法,用以解析基因组数据,我们在顶级的生物方法学杂志 Nature Biotechnology (两篇)和 GigaScience 发表论文,首次报告将光学图谱用于基因组组装和进行全基因组结构变异的关联分析。我们将全世界黄牛新分为5个截然不同的血统来源,并揭示一系列适应性进化,发表在 Nature communications 。找到两个主效基因分别导致北京鸭通体雪白和体重增加15%同时饲料转化效率提高6%,发表在 Nature communications 。

到目前为止总计发表SCI论文20余篇,被引用近1000次,其中以第一或通讯作者在 Science 、 Nature Biotechnology 、 Nature Communications 、 Cell Research 等学术期刊发表论文13篇。

四、参与项目和获得奖

在读博和博后工作期间,参与了昆明动物研究所王文研究员主持的973计划“重要家养动植物在人工选择下进化的遗传和基因组机制”,和973计划“人工选择与基因组进化”;及参与了EU FP7项目支持的3SR project和USDA支持的National Animal Genome Research Program。引进西北农林科技大学后,获得校引进人才科研启动基金的资助、省人才经费和国家自然基金委面上项目资助。获得2014年度中国科学院优秀博士学位论文奖、2015年“陕西省科技新星”称号、入选2016年陕西省“百人计划”创新人才、入选2018年“国家优秀青年科学基金项目”。

五、发表文章和报告情况

1.  Li D#, Dong Y#, Jiang Y#, … ,Wang W, A de novo originated gene depresses budding yeast mating pathway and is repressed by the protein encoded by its antisense strand。 Cell Research 20(4)(2010),408-420。

2.  Jiang Y#, Li Y#, Lee W#, … ,Zhang Y, Wang W, Venom gland transcriptomes of two elapid snakes (Bungarus multicinctus and Naja atra) and evolution of toxin genes。 BMC Genomics 12(1) (2011), 1-13。

3.  Dong Y#, Xie M#, Jiang Y#…, Wang J, Wang W, Sequencing and automated whole-genome optical mapping of the genome of a domestic goat。 Nature Biotechnology 31(2) (2013): 135-141 (ESI Highly Cited Papers)

4.  Jiang Y#, Xie M#, Chen W#…, Wang W, Dalrymple B。 2014。 The sheep genome illuminates biology of the rumen and lipid metabolism。 Science 344 (2014): 1168-1172。 (ESI Highly Cited Papers)

5.  Zhou Z#, Jiang Y#, Wang Z#…, Wang W, Tian Z。 Resequencing 302 wild and cultivated accessions identifies genes related to domestication and improvement in soybean。 Nature biotechnology 23(4) (2015): 408-414 (ESI Highly Cited Papers)

6.  Jiang Y#, Wang X#, Kijas J, Dalrymple B。 Beta globin gene evolution in the ruminants: evidence for an ancient origin of sheep haplotype B。 Animal Genetics (2015) 46: 506–514

7.  Dong Y, Zhang X, Xie M, …, Wang W*, Jiang Y* Reference genome of wild goat and sequencing of goat breeds provide insight into genic basis of goat domestication。 BMC Genomics (2015), 16:431

8.  Chen H, Jiang Y*, Progress and Prospects in Domestic Animals and Breeding: a Review of Genomic Copy Number Variations。 Biotechnology Bulletin (2015) 31(11): 35-42。

9.  Li M, Zhou H, Pan X, …, Zi X*, Jiang Y*, Cassava foliage affects the microbial diversity of Chinese indigenous geese caecum using 16S rRNA sequencing[J]。 Scientific Reports, 2017, 7。

10.  Wang X, Zheng Z, Cai Y, Chen T, Li C, Fu W, Jiang Y*。 CNVcaller: Highly Efficient and Widely Applicable Software for Detecting Copy Number Variations in Large Populations。  GigaScience, 2017。12。4, 6(12)

11.  Chen N, Cai Y, Chen Q,。。。, Jiang Y*, Lei C*。 Whole-genome resequencing reveals world-wide ancestry and multiple adaptive introgression events of domesticated cattle in East Asia。 Nature communications (2018) 9 (1), 2337

12.  Zhou Z, Li M, Cheng H,。。。,  Hou S*, Jiang Y*。 An intercross population study reveals genes associated with body size and plumage color in ducks。 Nature communications (2018)

13.  Wang X, Liu J, Niu Y, ,。。。, Jiang Y*, Chen Y* Low incidence of SNVs and indels in trio genomes of Cas9-mediated multiplex edited sheep。 BMC genomics (2018)